в БГУ добавлен был реквизит, в новую версию я скопировал это реквизит. При загрузке он очищается и типа новый создается... че за хня? раньше такого небыло.

при какой загрузке? загрузке конфы вместо текущей?

Через меню "Загрузить конфигурацию".

что может быть?

(2) загружаешь конфигу а потом по новой его добавляешь?

(4) нет. нетиповая конфа, добавлено пару реквизитов. Открыл новую версию. скопировал копипастом реквизиты в новую. сохраняю новую конфу. Делаю загрузить конфигурацию из файла в базе -  этот реквизит - очищается.. вроде раньше постоянно так делал этого эффекта небыло.

(5) что мешает сравнением объединять? имхо - у объекта другой гуид генерится, отчего и чистится

(6) так и есть

(6) ждать дольше, + это окно сравнения и объединение некоторых пугает, + оно оставляет объекты которые в новой конфе удалены если не настроить.

(7) а что раньше такого не было? это новая фича последних платформ?

есть вариант чтоб он не слетал?

(7) имхо, криво скопировал реквизит
(9) сравнение-объединение

(10) как его ровно скопировать?

взять старую версию, обновить до нужной, не трогая измненные реквизиты и все, что с ними связано, выгрузить cf.
А потом сравнить-объединить.
Ну и почитай http://infostart.ru/public/18562/