Подскажите как поступить, я хочу узнать ОсновнуюОрганизацию.
Такой код выдает ошибку если его запустить в 3.0
Если Метаданные.Синоним = "Бухгалтерия предприятия, редакция 3.0" тогда
Орг = БухгалтерскийУчетПереопределяемый.ПолучитьЗначениеПоУмолчанию("ОсновнаяОрганизация");
Иначе    
Орг = глЗначениеПеременной("ОсновнаяОрганизация");
КонецЕсли;

глЗначениеПеременной - Процедура в тройке не определена и наоборот если запускаем в двойке БухгалтерскийУчетПереопределяемый

напиши 2 обработки

Используй серверную функцию в 3

В макет обработки засунь свой код и вытаскивай его и через Выполнить() исполняй

и это только про ОсновнуюОрганизацию. что будет дальше?

Чтобы не ругалось можно выполнять вызовы функций через выполнить()

через Выполнить

+ а по-хорошему - помещай обработки в макеты обработки и запускай их с основной

(7) каждую строку макета в Выполнить(".....")?

(8) нет. создаешь макеты с двоичными данными, в которые помещаешь обработки для 1.6 и для 3.0
а при открытии формы основной обработки запускаешь программно ту или иную обработку

я бы в модуль запихнул проверку на релиз, а в формы раскидал по номеру