Вот такой код:

		ВыборкаДанные = Запрос.Выполнить().Выбрать();
		Пока ВыборкаДанные.Следующий() Цикл
			// останавливаем БП
			БизнесПроцессОбъект = ВыборкаДанные.Ссылка.ПолучитьОбъект();
			БизнесПроцессОбъект.ДатаЗавершения			= ТекущаяДата();
			БизнесПроцессОбъект.Завершен				= Истина;
			БизнесПроцессОбъект.Состояние				= Перечисления.СостоянияБизнесПроцессов.Остановлен;
			БизнесПроцессОбъект.РезультатВыполнения		= Перечисления.РезультатыВыполнения.Выполнено;
			БизнесПроцессОбъект.ОстановленАвтоматически	= Истина;
			БизнесПроцессОбъект.Записать();
		КонецЦикла;

Код проходит, ошибок нет, но с бизнес-процессаим ничего не происходит вообще.

А интерактивно остановиться получается, там лишь такой код на кнопке:

БизнесПроцессыИЗадачиКлиент.ОстановитьБизнесПроцессИзФормыОбъекта(ЭтотОбъект);

Процедура ОстановитьБизнесПроцессИзФормыОбъекта(Форма) Экспорт
	Форма.Объект.Состояние = ПредопределенноеЗначение("Перечисление.СостоянияБизнесПроцессов.Остановлен");
	ОчиститьСообщения();
	Форма.Записать();
	ПоказатьОповещениеПользователя(
		НСтр("ru = 'Бизнес-процесс остановлен'"),
		ПолучитьНавигационнуюСсылку(Форма.Объект.Ссылка),
		Строка(Форма.Объект.Ссылка),
		БиблиотекаКартинок.Информация32);
	ОповеститьОбИзменении(Форма.Объект.Ссылка);
	
КонецПроцедуры

Подскажите пожалуйста в чем может быть дело?

В Вашем коде нет БП.Записать()

и проверьте, что транзакция фиксируется

(1) есть
(2) нет транзакции

кстати так тоже не работает: БизнесПроцессыИЗадачиВызовСервера.ОстановитьБизнесПроцесс(ПараметрКоманды)

(0) Странненько, но я бы покурил модуль менеджера БП, скорее всего там есть что-то готовое для вашей задачи.

(3) Вы заблуждаетесь. Чудес не бывает.

(4) Перестаньте надеяться на оболочки типа БСП, а вызывайте прямые методы объектов платформы, которые делают дело.

(6) Явно тут не чудеса, но какая то дичь в платформе может.
(7) прямые методы тоже не работаю.

(8) ОповеститьОбИзменении(Форма.Объект.Ссылка);

смотри кто ловит это оповещение

(9) Это процедура оповещает форму списка чтобы там отобразились изменения

(8) что значит "БП не останавливается"?
Флажок "Завершен" установился?
Новые задачи создаются?

(11) это значит что ничего не происходит, код выполняется ничего не происходит

(12) В ЖР что пишется?

Разобрался, всем спасибо!

Поделился бы, что ты там записывал.
(6) как не грустно это слышать от Волшебника, но чудес не бывает