Подскажите, где это регулируется. Работало, потом перенёс базу - сломалось.

Кто-нибудь пользуется 1С-ным Документооборотом?

(1) наверняка

Попробовать в роль ДобавлениеИзменениеВходящихДокументов включить пользователя.

(3) Если я правильно понял, то надо у пользователя включить эту роль. Она уже была включена.

Если конфа не типовая, то простой способ создать роль, в которой дать право на чтение/изменение/редактирование входящих документов. Потом включить в эту роль пользователя.

Типовая 1.0.8.1

(6) Убиться какой старый релиз. Обновитесь бога ради. Даже говорить не о чем с таким старым релизом!