В обработке есть необходимость где-то хранить набор отчетов и их основных форм, и время от времени их вызывать. Как это лучше реализовать.

отчет скд?

да

(2) имел ввиду - в одном отчете несколько схем и настроек хранения

нет я сделал возможность настраивать условно назовем рабочий стол - обработка где динамически добавляются закладки с выбранными отчетами причем не важно на скд отчет или нет.

Справочник.СохраненныеНастройки не?

как справочники хранить ОтчетОбъект? или форму?

(6) Не понял сразу, что тебе надо.
В УПП - Сервис - Произвольные отчеты.

(7) я делаю настраивымые рабочие столы из отчетов которые есть в конфе (конфа полностью рукописная) у меня на этих столах начальник помешан и меня задолбала каждому писать отдельный стол, я решил сделать это настраиваемо. Выбрал человека выбрал тип стола и нужные отчеты и все само построилось.