Настроен двусторонний обмен между БП 2.0 и УТ 10.3, в обоих конфигурациях запускаю консоль запросов и выполняю запрос:

ВЫБРАТЬ
   Номенклатура.Код,
   Номенклатура.Родитель,
   Номенклатура.Наименование
ИЗ
   Справочник.Номенклатура КАК Номенклатура

В итоге в БП результат запроса: 28454 строки, а в УТ 28544. Регистрирую к обмену весь справочник "Номенклатура", делаю обмен, результат тот же. Где то же косяк? Не пойму где.

а в чем проблема сравнить эти 2 справочника. Делов то 3 клика мышки

Сохрнаить в mxl список и файл->сравнить файлы

(1)(2) Спасибо за то что пнул в нужном направлении. Посмотрел щас, оказывается была куча помеченных на удаление элементов номенклатуры, снял пометку, все синхронизировалось.