1С-ка обменивается данными с другой программой.
Обработка обмена лежит в дополнительных внешних обработках.
Куда запихать файл настроек, что бы не потерялся?

(0) внешний файл или регистр настроек.

(1) или создать в константах реквизиты

(1) Внешний файл могут потерять при переносе базы.
(2) Не хочу трогать конфигурацию. Пусть будет максимально стандартной.

Регистр Сведений Сохраненные настройки

Хранилище значений

(3) взаимное противоречие
кроме как хранить в интернете тогда не приходит в голову ничего

а вообще раскурить как хранятся внешние обработки или внешние печатные формы
и там хранить свои настройки