Взято из "Обороты Счета" (для примера делаю на 20счете):
////
ВЫБРАТЬ РАЗРЕШЕННЫЕ
   Субконто1 КАК Субконто1,
   ПРЕДСТАВЛЕНИЕ(Субконто1) КАК Субконто1Представление,
   Субконто2 КАК Субконто2,
   ПРЕДСТАВЛЕНИЕ(Субконто2) КАК Субконто2Представление,
   Субконто3 КАК Субконто3,
   ПРЕДСТАВЛЕНИЕ(Субконто3) КАК Субконто3Представление,
   КорСчет.Ссылка КАК КорСчет,
   КорСчет.Порядок КАК КорСчетПорядок,
   КорСчет.Представление КАК КорСчетПредставление,
   СуммаОборотДт КАК СуммаОборотДт,
   СуммаОборотКт КАК СуммаОборотКт,
   ВЫБОР КОГДА СуммаОборотДт <> 0 ТОГДА 1 ИНАЧЕ 0 КОНЕЦ КАК ЕстьСуммаОборотДт,
   ВЫБОР КОГДА СуммаОборотКт <> 0 ТОГДА 1 ИНАЧЕ 0 КОНЕЦ КАК ЕстьСуммаОборотКт
ИЗ
   РегистрБухгалтерии.Хозрасчетный.Обороты(&ДатаНач, &ДатаКон, , Счет В ИЕРАРХИИ (&Счет), , Организация = &Организация  И  Субконто3 = &Значение3) КАК Таблица

УПОРЯДОЧИТЬ ПО  Субконто1, Субконто2, Субконто3, КорСчетПорядок
ИТОГИ
   СУММА(СуммаОборотДт),
   СУММА(СуммаОборотКт),
   СУММА(ЕстьСуммаОборотДт),
   СУММА(ЕстьСуммаОборотКт)
   ПО ОБЩИЕ,
   Субконто1  КАК Субконто1,
   Субконто2  КАК Субконто2,
   Субконто3  КАК Субконто3, КорСчет ИЕРАРХИЯ КАК КорСчет
АВТОУПОРЯДОЧИВАНИЕ
//////
Вот этот запрос выполняется 40 мин.(на небольшой базе УПП за месяц)
Реально ли увеличить скорость данного запроса в разы т.к. необходимо посмотреть данные для большой базы, желательно за большой период.

В ИЕРАРХИИ замените на список счетов. Скорость увеличится в разы.
И по мелочи. Представления выкиньте. Они на хрен никому не нужны.

(1) Угу, пусть при выводе лучше тормозит, да?

(1) Без ИЕРАРХИИ все оч быстро. Спасибо. Что то не подумал на это.