Какой вид времени и вид времени по классификатору использования рабочего времени установлен у несторнируемого начисления (вторая вкладка свойств вида расчёта)? И что у него написано про оплату больничного листа в "вытесняющих начислениях" (последняя вкладка)? Тут скорее всего проблема именно в вытеснении.
(4)Ведущие начисления - это начисления, которые влияют на данный вид расчёта. Пересчитали Вы оклад - и этот вид расчёта тоже должен быть пересчитан.
Вам нужно добавить БЛ в вытесняющие начисления. Тогда этот вид расчёта будет вытесняться по периоду действия. И сторнироваться.
Компьютеры — прекрасное средство для решения проблем, которых до их появления не было.