Хочу в Служебные сообщения выводить ссылку на документ, так что при клике на нее выполнялся мой код. Возможно ли это?
Не могу вспомнить ни одну конфу, где это реализовано

Нельзя.
Можно сделать свою обработку выводящую сообщения. В любой типовой емнип есть.

ХЗ, тоже не видел чтоб через служебные док-т по ссылке открывали. Можно сделать свои служебные сообщения, с блек-джеком и шлюхами =)

(0)емнип,это можно в 8.3

а в 8.2 в УФ можно затухающее окно оповещения сделать,в которое точно можно поместить сслыку

(1) а название подскажите?

(5) анализ неявок

В ЗУПе поищи обработку. Там сообщения со ссылками в html-поле выводятся

+(7) называется "СообщенияВыполняемыхДействий"