Подскажите, откуда берется счет операционной кассы  90.01.1 счет в приходном кассовом ордере ? при открытии документа он подставляется автоматически. Можно ли его как то изменить, чтоб автоматически подставлялся другой счет?

А какой другой ?

По сути:
Дт 50 - Кт 62 Клиент
Дт 62 Клиент - Кт 90

т.к. Клиент не идентифицируется то получается Дт 50 - Кт 90

(2) пользователям необходим счет 50.02. где то можно ли это указать в настройках ??? в коде программы не могу найти где устанавливается этот счет?

настройками не решить, там в коде
СчетДт = ПланыСчетов.Хозрасчетный.КассаОрганизации
Сейчас точно не помню, мы флаг добавляли, то ли у Кассы, толи кассы ККМ "опер. касса", и если он установлен ставили счет 50.02

(4) спасибо. А где именно в коде не могли бы подсказать?

(5) строка 920

Глобальный поиск показал)
Документ.ПриходныйКассовыйОрдер.Модуль объекта(929, 3)

(7) (6) спасибо) а подскажите, а в отчет о розничных продажах счет дт откуда попадает в проводки?

как сформировать в УПП проводку Д 50.02 К 90. В отчете о розничных продажах по умолчанию встает 50.01. Может нужны дополнительные настройки?