Проверьте единицы измерения у номенклатур, заполнены ли они и правильно ли у них указаны владельцы?
Сталкивался где то с таким, что при подборе он ищет по ед.измерения, а не по номенклатуре и в результате добавлял кол-во не в ту позицию. Как оказалось бы косяк при переносе остатков и у некоторых номенклатур стояли чужие единицы измерения.
