Письмо ФНС 17.05.2016 № БС-4-11/8718@ и разъяснения на его основе - http://buh.ru/articles/documents/48598
Если кратко, то в разделе 2 должен быть показан доход, который не облагается НДФЛ по причине наличия стандартных (имущественных ??) вычетов. Плюс объяснение по ситуации, когда в начале месяца был применен вычет, потом превышен предел (350тыс, к примеру) - доначисление НДФЛ падает в раздел 2 блока по отражению того дохода, где и был превышен предел. Самое радостное, что реализация запланирована в релизе 2.5.107 от 27.07.2016.
Единственное не понял как они будут проверять доход, который не облагается НДФЛ по причине наличия вычетов - ведь по строке 130 нет контрольных соотношений?

В программе «1С:Зарплата и управление персоналом 8» редакции 3 такой порядок заполнения формы 6-НДФЛ поддерживается начиная с версии 3.0.25.125 от 11.07.2016.
Подробнее: http://buh.ru/news/uchet_nalogi/48705/
Там надо глянуть

(1) Да мы просто со вчерашнего дня сдавать начали, как раз вылез вопрос по поводу предоставленного вычета, который потом отменяется - сейчас НДФЛ с вычета вылезает самостоятельным блоком с суммой в строке 140 (последний релиз ЗУП).

(2)Я так и понял,но сам буду ждать 27.07.Еще надо волкова и малышкину посмотреть

(0) По итогам года сверятьс  2-НДФЛ. Как еще-то.

(4)У Волкова сказано, что помимо сверки с 2-НДФЛ по итогам года будут сверять с разделом 2 декларации по налогу на прибыль. В декларации по налогу на прибыль я не нашел упоминаний про НДФЛ. Интересно, как собираются сверять?

(5) сейчас же дивиденды, например, отражаются в декларации по прибыли, а не в 2-ндфл. вот их и будут сверять

(6) В 2-НДФЛ они тоже отражаются. В разделе со ставкой "13%" и кодом дохода 1010.