Добрый день!
Когда-то давно, года два назад, решал такую задачу. Делал, если память не изменяет, так: выполнял сохранение конфигурации старой базы в CF, запускал на базе-источнике некую обработку по выгрузке требуемых данных в XML, затем разворачивал новую базу из CF и запускал загрузку данных.
Но хоть убей не могу вспомнить - что за обработка. Она то ли стандартная, то ли я ее с ИТС брал. Никто не напомнит?