В узле изменен макет товарного чека в пользовательском режиме, чтобы в шапке выводились другие слова.

Как исключить этот макет из синхронизации?

Удалять регистрацию для обмена или есть какие то настройки на такой случай?

Сделай внешней печатной формой

настроек никаких нет. Можно попробовать удалить регистрацию после обновления конфига, но поможет или нет - надо пробовать. По идее, не будет совпадать хэш-код конфигураций и при получении пакетов будет прерываться загрузка с сообщением об ошибке. Это в том случае, если в самом деле 100%-ный РИБ, а не просто обмен между разными базами, который по старой привычке обзывают РИБ, а его там уже давно нет.

Обращаю внимание на то, что изменен "в пользовательском режиме" - это ключевые слова.

Имхо, если мне память не изменяет (я давно не работал в УТ), достаточно убрать регистрацию изменений перед обменом с регистра сведений "Пользовательские макеты печати". Попробуй.

Убрал из регистрации, время покажет как это работает.

(5) Нормально это "работает". До тех пор, пока юзвера не внесут изменения :( Тогда такая "расинхронизация" в данных объекта будет "затёрта" при обмене и придётся вновь изменять и удалять регистрацию изменения в одном из узлов.