Из УТ выгружается 2 орг.Потребовалось выгружать еще одну...
Добавил ее в Фильтрацию справочников/организации...
Сделал обмен...в бп организация появилась без кода...а док-ты по реализации не перенеслись....
Обмен никогда не настраивал и не занимался им...
Не подскажете порядок действия при добавлении новой организации...

Каких-то изысков нет. Надо смотреть по факту.
В каталогах шаблонов БП 2.0 есть хтмл-документ "Совместное использование"

Попробуйте принудительно зарегистрировать документы реализации в узле обмена.