Причем слетают даже те, которые не правились. Надо обновлять на компе с маленьким разрешением?

что значит "слетают"

Чистка кэша иногда помогает

(2) Чистка кеша помогает на один раз, если закрыть программу и открыть, то опять форма маленькая, надо чистить кешь и тогда на один раз нормальная становится.

не обновляйся на компьютере, у которого масштаб монитора <> 100%

(4) не совсем понял, я тоже думаю дело в этом.
100% от чего?
как поправить уже слетевшие?

(5) 100% от пикселя:

поправить слетевшие - взять бэкап с неслетевшими формами, накатить обновление с масштабом 100%

добавить в полный план обмена регистрацию измененных в базе со слетевшими формами данных с помощью http://catalog.mista.ru/public/85880/ и перегрузить их через XML  с помощью стандартной обработки с ИТС