Если ставлю "соответствует оплате труда" в настройках кода НДФЛ 2002 дату ставит нормальную, концом месяца, но в справку 2-НДФЛ ставит код 2000.

(0) когда выплатили деньги на руки сотруднику, тот месяц и должен быть.