Пользователи сбили нумерацию. Чтобы не переименовывать, решили сделать программную установку номеров, которая игнорировала бы неправильные номера.
В модуле объекта дописал процедуру установки номера:

Процедура ПриУстановкеНовогоНомера(СтандартнаяОбработка, Префикс)
    
    ГодДаты = Год(Дата);
    Если ГодДаты <> 2018 Тогда
        Возврат;
    КонецЕсли;
    
    Запрос = Новый Запрос;
    Запрос.Текст =
        "ВЫБРАТЬ ПЕРВЫЕ 1
        |    РеализацияТоваровУслуг.Номер КАК Номер
        |ИЗ
        |    Документ.РеализацияТоваровУслуг КАК РеализацияТоваровУслуг
        |ГДЕ
        |    НАЧАЛОПЕРИОДА(РеализацияТоваровУслуг.Дата, ГОД) = &НачалоГода
        |    И НЕ ПОДСТРОКА(РеализацияТоваровУслуг.Номер, 7, 2) = ""43""
        |    И НЕ ПОДСТРОКА(РеализацияТоваровУслуг.Номер, 7, 2) = ""44""
        |
        |ДЛЯ ИЗМЕНЕНИЯ
        |
        |УПОРЯДОЧИТЬ ПО
        |    Номер УБЫВ";
    
    Запрос.УстановитьПараметр("НачалоГода", НачалоГода(Дата));
    
    РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
    
    Выборка = РезультатЗапроса.Выбрать();
    
    Если Выборка.Следующий() Тогда
        ЧислоМаксНомер = Число(Выборка.Номер);
        НужноеЧисло = ЧислоМаксНомер + 1;
        Номер = Прав("0000000000000"+Формат(НужноеЧисло,"ЧГ="),11);
        СтандартнаяОбработка = Ложь;
    КонецЕсли;
    
КонецПроцедуры

Контроль уникальности номеров включен, и даже иногда выдает ошибки. Но тем не менее, периодически возникает задвоение номеров.
Как удается записаться в базу документам с одинаковыми нумерами, и что с этим сделать можно?

обмен?

(1) нету. Создаются вручную, когда время близкое. т.е. как-то почти одновременно.
Была проблема, когда номер присваивался, но документы не записывался из-за ошибки заполнения. Но я сделал, чтобы номер заново присваивался в этом случае.
Даже сделал доп проверку в "ПриЗаписи", но все равно задвоения возникают изредка.

Режим блокировок какой?
Ну и периодичность нумерации и контроль уникальности.

(3)Автоматический, в пределах года, автонумерация = истина, контроль уникальности = истина. Все стандартно в этом плане для ут10.3

(4) А установка нового номера у тебя всегда в неявной транзакции?

Наложи вручную, я порядок событий навскидку не помню

(5) оно в предопределенной процедуре... казалось бы, должно быть в транзакции. Возможно, надо проверить это.
(6) А как тут вручную наложить? на что?

(6) v8: Как установить новый номер документа с префиксом из этого обсуждения следует, что внутри транзакции все происходит.

(0) - помню, было что-то такое в Далионе.. к сожалению, нет сейчас базы посмотреть, забылось...
В УТ 10.3 + БИТ CRM8 была немного другая задача (для разных видов документов сделать по разным алгоритмам),  но тоже косяки с нумерацией до этого случались, сейчас вот такой код, наверняка, не самое грамотное решение, но работает...
Писала в процедуру ПередЗаписью модуля формы документа, в конец.

Если ЭтоНовый() Тогда
        
                
        тГод  = Прав(Год(Дата),2);
        тМес  = Месяц(Дата);
        
        если стрДлина(тмес)<2 тогда
            тМес = "0"+тМес;
        КонецЕсли;
        
        тДень = День(Дата);
        
        если стрДлина(тДень)<2 тогда
            тДень = "0"+тДень;
        КонецЕсли;

        
        Если НЕ ЗначениеЗаполнено(Документы.ЗаказПокупателя.НайтиПоНомеру("ТКЗ"+тГод+тМес+тДень+"01",Дата)) Тогда
            ЭтотОбъект.Номер = "ТКЗ"+тГод+тМес+тДень+"01";
        иначе
            
            Запрос = Новый Запрос;
            Запрос.Текст =
            "ВЫБРАТЬ
            |    МАКСИМУМ(ЗаказПокупателя.Номер) КАК Номер,
            |    ЗаказПокупателя.Организация
            |ИЗ
            |    Документ.ЗаказПокупателя КАК ЗаказПокупателя
            |ГДЕ
            |    ЗаказПокупателя.Дата МЕЖДУ &дата1 И &дата2
            |
            |СГРУППИРОВАТЬ ПО
            |    ЗаказПокупателя.Организация";
            
            
            Запрос.УстановитьПараметр("дата1", НачалоДня(ЭтотОбъект.Дата));
            Запрос.УстановитьПараметр("дата2", КонецДня(ЭтотОбъект.Дата));
            
            
            
            РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();
            
            ВыборкаДетальныеЗаписи = РезультатЗапроса.Выбрать();
            
            Если  ВыборкаДетальныеЗаписи.Количество()>0 тогда
                Пока ВыборкаДетальныеЗаписи.Следующий() Цикл
                    максНом = ВыборкаДетальныеЗаписи.Номер;
                    хвост =Число(Прав(максНом,2))+1;
                    если хвост<10 тогда
                        хвост= "0"+строка(хвост);
                        ЭтотОбъект.Номер=Лев(ВыборкаДетальныеЗаписи.Номер,9) +хвост;
                    КонецЕсли;
                    
                КонецЦикла;
            иначе
                ЭтотОбъект.Номер = "ТКЗ"+тГод+тМес+тДень+"01";
            КонецЕсли;
            
                    
        КонецЕсли;
    иначе
        ЭтотОбъект.Номер =Номер;
    конецЕсли;
    
    
    Если День(ЭтотОбъект.Дата)<>День(ТекущаяДата()) тогда
     ЭтотОбъект.ДополнениеКАдресуДоставки = "Данный документ был создан\изменен "+ТекущаяДата() +" "+ ЭтотОбъект.ДополнениеКАдресуДоставки;
    КонецЕсли;

(8) Оно работает при записи нового, а никак не при перезаписи исправленного существуюшего. Короче. Отставляя в стороне вопрос о проскакивании платформенного контроля уникальносьи пока. Переноси свой запрос и присваивание исправленного номера в призаписи. Там у тебя и транзакция для блокировки будет и возможность переприсвоить исправленный номер... И свой текущий документ из запроса выбросить не забудь

(10) а зачем при перезаписи существующего? К тому же, как я буду из "ПриЗаписи" узнавать, нужен ли новый номер или нет? Если стандартнаяОбработка при присвоении номер ложь будет, то номер не присвоится, и он не запишется просто, как я понимаю
Разве что если это поможет с транзакцией? Логичнее тогда уж в ПередЗаписью()...

Перед записью нет транзакции,если мы меняем свой номер,то кио тоо параллельно может поставить такой же,и потом транзакция записи уже отработает на двух документах,и будет два одинаковых номера

(12) Мне кажется, ты ошибаешься.
http://catalog.mista.ru/public/153748/
вот описание. ПередЗаписью() модуля объекта уже в транзации, так же, как и присвоение номера.