Есть УПП 1.3 на 8.3.12 и есть абсолютно чистая пустая конфигурация также соответственно на 8.3.12.

Вопрос: как можно перенести часть метаданных (пару справочников) вместе с данными из УПП в чистую конфигурацию с минимальными затратами?

ВыгрузкаЗагрузкаДанныхXML82.epf

(1) для этого нужно сначала создать справочники в чистой конфигурации, причем полностью идентичные. Не подходит.

(2)[Не подходит]
почему

(0) сначала через сравнение с конфигурацией из файла переносишь справочник и метаданные, относящиеся к этому справочнику, потом копируешь только нужные общие модули, а затем уже когда всё будет проходить синтаксический контроль, то ВыгрузкаЗагрузкаДанныхXML82.epf

Создать пару справочников без реквизитов, выгрузить и загрузить их наименования. Минимальная задача решена. Нужно больше? Ставь конкретнее задачу. Самому себе, например.

(5) логично, в целом можно через КД создать правила

(1) (4) поддерживать актуальность данных в дальнейшем через ВыгрузкаЗагрузкаДанныхXML82.epf не самое лучшее решение

(7) Вопроса поддерживать актуальность не стояло. Для разового переноса ВыгрузкаЗагрузкаДанных работает нормально. Если постоянно - то можно правила (КД 2) написать.