Перенесли остатки товаров с КА1 в КА2 31.12.2019, теперь процедура закрытия требует закрыть декабрь, как то не логично, перенести остатки на 01.01?

Не хотите закрывать 31.12 и уверены, что всё ок - сдвиньте задание в регистре сведений

(1)Если так сделать - сдвинуть задание, а документы ввода остатков оставить в декабре - по ним же партии не посчитаются.

(2) Тогда к чему глупые вопросы? Если требуется закрыть, закрывай