Конфа УТ 11.4.6.174
1. Организация "А" принимает товар на комиссию и передает этот товар на субкомиссию организации "Б".
2. Организация "Б" продает товар покупателю.
3. Организация "А" Оформляет отчет комиссионера от организации "Б" и оформляет отчет комитенту поставщику.
Тут все ок.
4. Организация "Б" получила возврат от покупателя товара и организация "А" оформляет отчет комиссионер от организации "Б" со знаком минус,  Вид запасов товара становится собственным и нет возможности оформить сторнирующий отчет комитенту.

Что я делаю не так?

Очень давно ковырял комиссионку, но насколько помню такая фигня тянется уже очень давно как минимум с 2013 года  ((

В каком документе вид запасов становится собственным, в возврате?

(2) в документе "Отчет комиссионера" на  Организацию "А" в котором субкомиссионер организация "Б" в роли партнера.
все документы Организации "Б" за контуром учета для простоты воспроизведения.

т.е еще раз в кратце
Получили комиссионный товар
Отдали его на субкомиссию
получили отчет комиссионера с субкомиссии
Отчитались комитенту .
на этом этапе проблем нет.
Далее получаем с субкомисии сторнирующий отчет комиссионера (потому что субкомиссионеру покупатель вернул товар)
и вот на этом отчете вид запасов товара становится собственным.
соответственно имеем что на субкомиссии находится собственный товар (((

Еще упрощаю, если водном отчете комиссионера (отчет с субкомиссии) указать одну строку продаж,и а вторую такую же только со знаком минус как сторнирующую, то по сторнирующей строке ставится вид запасов собственный а на первую строку предлагает оформить отчет комитенту....