(0) учетную политику организации ПКО проверьте, является ли плательщиком НДС, а еще лучше под отладчиком посмотреть, какая система налогообложения выбирается при пробитии чека и почему
(1) в других документах печатается правильно в чеке НДС
Чтобы обнаруживать ошибки, программист должен иметь ум, которому доставляет удовольствие находить изъяны там, где, казалось, царят красота и совершенство. Фредерик Брукс-младший