создал справочники дети и сотрудники, на форме есть поле Дети типа булево .
  вопрос: как сделать так,чтобы при поставленной галочке Дети отображались только сотрудники с детьми?

если это управляемые формы и динамический список тогда вместо галочки на форме можно сделать отбор и добавить его в пользовательские настройки с быстрым выбором, чтобы элемент управления сам создался в соответствующей группе

сделал справочник сотрудники владельцем справочника дети, создал форму выбора,а как дальше не знаю.
подскажите,правильно делаю? (1)

(2) пока да

теперь надо у ДС сделать источником данных произвольный запрос и добавить туда что-то типа

1 в (выбрать первые 1 из справочник.Дети как дети Где Дети.Владелец = Сотрудники.Ссылка) КАК ЕстьДети

Выбрать первые 1 1

ну и по этому полю сделать отбор как в (1)