Из конфигуратора запускаю приложение на отладку. Запускается и тут же закрывается, а потом открывается но уже без привязки к конфигуратору и отладке. По чему такое может происходить и как это исправить? Да иногда запускается не вылетая, когда и как запустится не понятно.

(1) Да отладка под тонким клиентом. Или точнее стандартная по F5.