Существует ли документация по API методам Sigma? В стандартной обработке для 1с используются несколько методов, но их функционала не достаточно, может быть у этих методов есть какие-то параметры, может кто сталкивался и есть документация?

Ставь дрова, в папке установки должен быть мануал

(1) дрова тут ни причем. Сигма это отдельная тема

(0) Атол заявляет что апи открытое, так что напиши им в поддержку документацию должны дать.

Ну и еще посмотри может свагер на их апи доступен