Коллеги, задача такая, правила переноса номенклатуры, часть синхронизируется по ГУИД, часть по коду. Как реализовать отключение поиска по ГУИД программно?

галочку снять?

(1) Программно как ее снять по условию?

сделать 2 разных ПКО и вызывать по условию

(3) Все проще, нарыл.
В ПередВыгрузкой пишем

Если Источник.ПринадлежитЭлементу(Параметры.ГруппаНоменклатурыСКЗ) Тогда
    СинхронизироватьПоИдентификатору=ЛОЖЬ;
Иначе
    СинхронизироватьПоИдентификатору=ИСТИНА;
КонецЕсли;

ну все так и думали